王鎮恒是我國早期從事茶樹解剖學研究學者之一。從20世紀60年代起，他便開始對茶樹內部結構進行解剖研究。當時，國內的茶樹解剖研究上屬空白，學校的科研條件較差，他克服困難，僅憑一架普通光學顯微鏡，一邊觀察，一邊用手描繪茶樹內部結構圖。1963年，他在全國園藝會上宣讀了論文《茶樹葉片內部結構的研究》。
文化大革命結束后，王鎮恒繼續開展對茶樹內部結構的研究，于1978年10月在全國農學會學術討論會上宣讀論文《茶樹根的內部結構研究》。此后，他帶領青年教師和研究生，運用光學顯微鏡和電子顯微鏡，陸續對茶芽、葉片、茶根、茶花、茶果、茶枝、茶籽以及胚胎、茸毛的內部顯微結構，掌握了其變化規律，發表了多篇研究論文。
20世紀80年代，王鎮恒對茶樹的維管組織進行了解剖研究。他從整體出發，對茶樹維管組織結構形態以及各個發育階段的特點作了全面研究。
王鎮恒對茶樹植物學的特征，特性所作的內部結構研究，將不同部位的組織開展較為系統的解剖，為茶葉的高產優質栽培技術提供理論依據。
